Pencak silat menjadi salah satu kegiatan ekstrakurikuler unggulan di MTs Al-Muhajirin. Kegiatan ini tidak hanya melatih keterampilan bela diri siswa, tetapi juga menanamkan nilai-nilai luhur seperti keberanian, kedisiplinan, dan penghormatan terhadap sesama.
Latihan pencak silat dilaksanakan secara rutin dengan bimbingan pelatih profesional yang berpengalaman. Siswa diajarkan berbagai teknik dasar hingga tingkat lanjutan, serta diberikan pemahaman tentang filosofi pencak silat yang kaya akan nilai budaya dan spiritual.
Selain itu, siswa juga didorong untuk mengikuti berbagai kejuaraan pencak silat, baik di tingkat lokal maupun nasional, sebagai upaya untuk mengembangkan potensi mereka. Melalui kegiatan ini, MTs Al-Muhajirin berkomitmen mencetak generasi yang tidak hanya unggul secara fisik, tetapi juga memiliki karakter Islami yang kuat dan tangguh.